Naprapaten undersöker och behandlar utifrån ett funktionstänkande. Ofta är smärtor orsakade av störd funktion (på olika sätt), mer än av skadad vävnad. Samspelet mellan ledrörlighet och muskelfunktion är det viktiga. Nervsystemets funktion spelar här en viktig roll. Naprapaten behandlar utifrån detta perspektiv och använder då ledkorrigerande behandling i kombination med mjukdelsbehandling (ex massage, stretching).